2 年 ago
清, 宇
2 minutes

(執筆 2021/5/9)
Jupyter Notebookを使うなら、UbuntuでもAnacondaでサクッと環境構築で楽したい。

Anacondaをインストール

image.png
bash Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh
image.png
conda config --set auto_activate_base false

と入力することで、自動的に有効にならなくなります。逆に、自動的に有効にする設定は、

conda config --set auto_activate_base true

です。手動でcoda環境を有効にしたい場合は、

conda activate

無効にしたい場合は、

conda deactivate

と入力します。アップデートや、インストールなどのcondaで始まるコマンドは、仮想環境が有効になってる必要はありませんが、Jupyter Notebookを立ち上げるときは、有効にしておく必要があります。

pathは、.bashrcに追加されていますので、今のterminalを閉じて、再度terminalを開きなおせば、以下のコマンドでインストールが確認できます。

conda -V

最新バージョンにするために、以下のコマンドを入力します。

conda update --all

再度、conda -V でバージョンを確認すると、バージョンが上がっています。

ブラウザの変更

初期値では、Firefoxが立ち上がります。これをChromeやMicrosoft Edgeに変更するには、以下の操作が必要です。

jupyter notebook --generate-config

これで、~/.jupyter/jupyter_application_config.py が出来上がりますので、その中の c.NotebookApp.browser の行にある＃を消してしまえば、Ubuntuに設定したデフォルトのウェブブラウザーで起動するようになります。

# c.NotebookApp.browser = ''

c.NotebookApp.browser = ''

Jupyter Notebook拡張機能のインストール

既に、Jupyter Notebookも使えるようになっているので、conda環境が有効になってる状態でterminalに以下のコマンドを入力して起動できます。

jupyter notebook

このままでも使えるのですが、便拡張機能をインストールしておきます。

conda install -c conda-forge jupyter_contrib_NbExtensions
image.png

RとRStudioのインストール

condaからRやRStudioのインストールもできますが、公式からインストールします。
https://cran.r-project.org/ から、Download R for Linux -> ubuntu と進んでいくと、インストール方法が記載されたページにたどり着きます。そのページにあるコマンドを管理者権限で実行してください。参考として、2021/5/9時点でのインストール方法を以下に書きます。

sudo apt update -qq
sudo apt install --no-install-recommends software-properties-common dirmngr
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu $(lsb_release -cs)-cran40/"

ここで追加したレポジトリは、ubuntu のバージョンを見て作成されます。時期によってはまだレポジトリが用意されていないため apt update でエラーが出ることがあります。その場合は、前のバージョンのリポジトリに置き換えることが必要になります。
バージョンは、数字ではなくコードネームが使用されます。Wikipediaを参照してコードネームを確認しましょう。
以下の例は、Ubuntu 21.04の場合で、20.10のgroovyに書き換えています。そのうちリポジトリができると思いますので、元のはコメントアウトして残しておいた方がいいと思います。

#deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu hirsute-cran40/
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu groovy-cran40/

そのあと、update&upgradeをかけて、r-baseをインストールします。

sudo apt update
sudo apt upgrade -y
sudo apt install --no-install-recommends -y r-base

RStudioは、 https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download からUbuntu 18用のdebファイルをダウンロードして、gdebiでインストールします。

sudo apt install gdebi
sudo gdebi rstudio-1.4.1106-amd64.deb
image.png

Jupyter Notebook へ R を登録

コマンドプロンプトでconda環境を有効にした上で、Rを起動し、以下のコマンドを1行ずつ入れます。

install.packages('IRkernel')
IRkernel::installspec()
image.png
image.png

Power Shellの登録

image.png
# 20.10
wget https://packages.microsoft.com/config/ubuntu/20.10/packages-microsoft-prod.deb -O packages-microsoft-prod.deb
sudo dpkg -i packages-microsoft-prod.deb
# SDK
sudo apt-get update; \
  sudo apt-get install -y apt-transport-https && \
  sudo apt-get update && \
  sudo apt-get install -y dotnet-sdk-5.0

次に、dotnet-interactive をインストールして、jupyter notebookに登録します。コマンドプロンプトから、以下のコマンドを入れます。

dotnet tool install --global Microsoft.dotnet-interactive

次のコマンドは、そのまま実行するとコマンドが見つからないと出てきますので、一度、ログアウトして再ログインしてから実行します。

dotnet interactive jupyter install

これで、UbuntuでもPower Shellが実行できるようになりました。

image.png
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