php.iniにdisable_functionsオプションがありません
確かにphp.iniファイルではdisable_functionsオプションはデフォルトで提供されていません。
特定の関数を無効にするには、php.iniファイルにdisable_functions = 関数名1, 関数名2, …を手動で追加します。例えば、execやsystem関数を無効にするには、php.iniファイルに以下の行を追加します。
disable_functions = exec, system
php.ini ファイルを変更したら、変更を反映させるために、PHP サービスを再起動する必要があります。